Caracterización molecular de tres líneas de Cavia porcellus mediante la aplicación de AFLP

Authors

  • Carlos Solarte
  • Heiber Cárdenas Henao
  • Carol Rosero Galindo
  • William Burgos Paz

DOI:

https://doi.org/10.17533/udea.rccp.324111

Keywords:

AFLP, Cavia porcellus, genetic variability

Abstract

Los marcadores moleculares son una herramienta eficaz para determinar variabilidad genética entre y dentro de poblaciones, pero en el caso de Cavia porcellus, no existen reportes referentes al uso de estas técnicas. Con los marcadores moleculares AFLP´s (Amplified Fragment Length Polimorphism), se analizaron tres poblaciones, dos criollas y una mejorada genéticamente, sometida a selección durante varias generaciones y obtenida a partir del cruzamiento entre animales peruanos y nativos de Nariño. Para obtener los marcadores moleculares AFLP´s (Amplified Fragment Lenght Polimorphism), se utilizaron en total cinco combinaciones de cebadores, tres combinaciones recomendadas para el orden Rodenthia y dos por la casa fabricante del Kit, de las cuales sólo una de ellas, con 116 loci, permitió establecer diferencias entre las poblaciones estudiadas, de acuerdo con el valor de distancia genética insesgada de Nei (p < 0.01). Las dos poblaciones criollas constituyeron un grupo estrechamente relacionado y distante de la población mejorada genéticamente, lo que indica que los animales importados absorbieron al criollo. De acuerdo con los valores de heterocigosidad promedio, que variaron entre 0.48% y 14.48%, y el porcentaje de polimorfismo que osciló entre 0.00% y 39.65%, se deduce una baja variabilidad intrapoblacional, siendo la población mejorada genéticamente la más polimórfica. La baja variabilidad entre los animales mejorados, se explica por la intensa selección a la que han sido sometidos, mientras que en los núcleos criollos este fenómeno puede atribuirse al bajo tamaño efectivo en las dos poblaciones. Los resultados de esta investigación sugieren un replanteamiento de los programas de mejoramiento genético y conservación de los recursos genéticos autóctonos en la región.

Summary

Molecular markers are a powerful tool to determine genetic variability within and among populations, but for the Cavia porcellus there are no reports on the use of these techniques. Three populations, two native and another one, genetically improved which was obtained by crossing native and Peruvian animals and submitted to genetic selection through several generations were analyzed by means of AFLP markers. Five primer's combinations recommended for Rodenthia were used, but only one allowed to establish significant differences (p < 0.01) according to unbiased Nei´s distance Value. Both native populations were grouped in a cluster genetically distant from the genetically improved animals. This showed that foreign animals absorbed the native populations. The average heterosigosity between 0.48% and 14.48% and the percentage of polymorphisms between 0.00% and 39.65% allow to conclude that there was a low variability between the populations, but the population genetically improved was the most polymorphic. The low variability within the improved animals it can be explained because of the intensive selection procedures use with them, whereas within the native populations can be explained because of their very low populations effective size. These results suggest that there is a need to restate the genetic improvement and preservation programs of the native Cavia porcellus in the southwest region of Colombia.

 

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References

Boldman KG, Van Vleck LD. Derivative - Free Restricted Maximum Likelihood estimation in animal models with a sparse matrix solver. J Dairy Sci 1991; 74:4337. DOI: https://doi.org/10.3168/jds.S0022-0302(91)78629-3

Caycedo A. Línea de investigación en cuyes y sus alcances en la tecnificación de la explotación. 1 ed. Pasto-Colombia: Universidad de Nariño; 1993. 24 p.

Caycedo A. Experiencias investigativas en la producción de cuyes. Contribución al desarrollo tecnológico de la explotación. 1 ed. Pasto-Colombia; Facultad de Ciencias Pecuarias, Universidad de Nariño; 1999. 509 p.

Chauca L. Producción de cuyes Cavia porcellus. FAO INIA 1997; [20 Septiembre 2005] URL: http://www.fao.org.

Dragoo JW, Salazar-Bravo J, Layne LJ, Yates TL. Relationships within the Calomys callosus species group based on amplified fragment length polymorphisms. Bioch Sys Ecol 2003; 31: 703-713. DOI: https://doi.org/10.1016/S0305-1978(02)00230-2

Excoffier L, Smouse PE, Quattro JM. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: Application to human mitochondrial DNA data. Gene 1992; 131:479-491.1992; 131:479-491.131:479-491. DOI: https://doi.org/10.1093/genetics/131.2.479

Fisher RA. Statistical methods for research workers. 10th ed. Edinburgh: Oliver and Boyd; 1954.Edinburgh: Oliver and Boyd; 1954. 1954.

Henderson CR. Theoretical basis and computational methods for a number of different models. Proc. Of animal model Workshop. Edmonton, Alberta: American Dairy Science; 1988. 125 p. DOI: https://doi.org/10.1016/S0022-0302(88)79974-9

Instituto Nacional de Estudios Ambientales (IDEAM). 1999. Reporte de climatología de la estación Botana. Pasto-Colombia: El instituto; 1999.

Invitrogen. Instruction manual AFLP Analysis System I, Starter Primer Kit version B 2003; �RL http://www.invitrogen.com/content/sfs/manuals/AFLPi.pdf

Lynch M, Milligan BG. Analysis of population genetic structure with RAPD markers. Mol Ecol 1994; 3:91-99. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.1994.tb00109.x

Manly BFJ. Randomization and Montecarlo methods in biology. New York: Chapman and Hall; 1991. DOI: https://doi.org/10.1007/978-1-4899-2995-2

Meyer K. Estimating variance and covariances for multivariate animal model by restricted maximum Likelihood. Gen Sel Evol 1991; 23:67. DOI: https://doi.org/10.1051/gse:19910106

Miller MP. Tools for Populations Genetic Analysis (TFPGA) version 1.3. A Windows Program for the Analysis of allozyme and Molecular Population Genetic Data 1997; �RL http://herb.bio.nau.edu/∼miller/tfpga.htm.

Nei M. Genetic distance between populations. Amer Nat 1972; 106:283-290.106:283-290. DOI: https://doi.org/10.1086/282771

Nei M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Gene 1978; 89:583-590. DOI: https://doi.org/10.1093/genetics/89.3.583

Ortegón M, Morales F. El Cuy. 1 ed. Pasto-Colombia: Facultad de Zootecnia �niversidad de Nariño; 1987. 295 p.18. Raymond ML, Rousset F. An exact test for population differentiation. Evol 1995; 49:1280-1283. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1558-5646.1995.tb04456.x

Sokal R, Rohlf FJ. Biometry. 3rd ed. New York: W.H.3rd ed. New York: W.H. Freeman and Co; 1995.

Solarte C, Viteri L. Indice de selección, prueba de progenie y prueba de comportamiento en cuyes Cavia porcellus. Zoot 2001; 4:35-44.

Solarte C, Soto F, Pérez T. Modelo animal multicarácter para la estimación de parámetros genéticos del Cavia porcellus en Colombia. Rev Cuba Cienc Agríc. 2000; 36:19-24.

Solarte C, Imuez M, Pérez T. Modelo animal multicarácter para la selección de reproductores Cavia porcellus en Colombia. Rev Cuba Cienc Agríc. 2000; 36:25-30.

Vos P, Hogers R, Bleeker M, Reijans M, Van de Lee T, et al AFLP: a new technique for DNA fingerprinting.AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucl Acid Res 1995; 23:4407–4414.1995; 23:4407–4414. 23:4407–4414. DOI: https://doi.org/10.1093/nar/23.21.4407

Wright S, Evolution in Mendelian populations. Gene 1931; 16: 97-159. DOI: https://doi.org/10.1093/genetics/16.2.97

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Published

2016-07-22

How to Cite

Solarte, C., Cárdenas Henao, H., Rosero Galindo, C., & Burgos Paz, W. (2016). Caracterización molecular de tres líneas de Cavia porcellus mediante la aplicación de AFLP. Revista Colombiana De Ciencias Pecuarias, 20(1), 10. https://doi.org/10.17533/udea.rccp.324111

Issue

Section

Original research articles