Hydrophobic Cluster Analysis (HCA) revela la existencia de isoformas de baja identidad de Lacasas (EC 1.10.3.2) en 7 Phyla de bacteria

Autores/as

  • Jorge Hernández-Torres Universidad Industrial de Santander
  • Jhon A. Rodríguez-Buitrago Universidad Industrial de Santander
  • Jacques Chomilier Université Paris 6

Palabras clave:

análisis de agregados hidrofóbicos, duplicación intragénica, EC 1.10.3.2, HCA, lacasa, p-difeno, oxígeno-oxidorreductasa

Resumen


Se implementó la metodología Hydrophobic Cluster Analysis (HCA) para evaluar la presencia y distribución de las lacasas (p-difenol:oxígeno-oxidorreductasas) en Bacteria. Por su alto nivel de resolución en entornos de baja identidad (< 30%), el análisis estructural mediante HCA fue capaz de validar secuencias huérfanas alojadas en las bases de datos Genbank y Swissprot. Se proponen consensos (LOGO) para los centros de cobre,  ̇tiles para la identificación de nuevas lacasas. De la misma manera que en Coprinus cinereus, en la lacasa CotA de Bacillus subtilis se encontraron evidencias de un evento de duplicación intragénica [aminoácidos 1 a 178 (dominio A) y 303 a 503 (50 residuos del dominio B y todo el dominio C)]. La identidad entre los duplicados se calculó en 9%. Estos resultados permiten concluir que las lacasas de Bacteria y Eucarya tuvieron un ancestro común.

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Publicado

2017-10-26

Cómo citar

Hernández-Torres, J., Rodríguez-Buitrago, J. A., & Chomilier, J. (2017). &lt;i&gt;Hydrophobic Cluster Analysis&lt;/i&gt; (HCA) revela la existencia de isoformas de baja identidad de Lacasas (EC 1.10.3.2) en 7 &lt;/i&gt;Phyla&lt;/i&gt; de bacteria. Actualidades Biológicas, 28(85), 101–114. Recuperado a partir de https://revistas.udea.edu.co/index.php/actbio/article/view/329378

Número

Sección

Artículos completos