Caracterização genética de ovinos crioulos colombianos
DOI:
https://doi.org/10.17533/udea.rccp.v30n2a03Palavras-chave:
conservação, DNA, diversidade genética, gado ovino, estrutura populacionalResumo
Antecedentes: as raças crioulas, devido a sua seleção natural em ambientes hostis e adaptação às condições regionais, são importantes para os agricultores de poucos recursos econômicos. Porém, na Colômbia, devido ao cruzamento indiscriminado com raças estrangeiras e a falta de controle na reprodução, tem aumentado a consanguinidade nas populações de ovinos crioulos e por tanto tem gerado perda na produtividade, o que faz supor um grande risco para a conservação de genes valiosos. Objetivo: determinar a diversidade genética em raças crioulas colombianas utilizando um painel de 10 marcadores moleculares microssatélites. Métodos: visitaram-se 43 granjas localizadas em 11 departamentos do país, nos quais foram amostrados 362 indivíduos, que foram genotipados e analisados para um painel de 10 marcadores microssatélites. Resultados: um total de 134 alelos foram encontrados (média de 13,4 alelos/locus), com um rango de heterocigocidade observada e esperada de 0,428 a 0,831 e 0,615 a 0,855, respectivamente, e um conteúdo de informação polimórfica (PIC) médio de 0,742. O Wright F-statistics (FIS) médio das raças avaliadas foi de 0,107, o qual sugere que as raças apresentam níveis moderados de consanguinidade. As ovelhas colombianas apresentaram um baixo grau de diferenciação genética entre as diferentes raças (FST = 0,054) e o análise de STRUCTURE mostrou complexos patrões de mistura nas raças estudadas. Conclusão: em termos gerais, as ovelhas colombianas apresentaram uma alta variabilidade genética, o qual é muito importante para futuros programas de conservação e melhoramento genético.
Downloads
Referências
Arora R, Bhatia S. Genetic diversity of Magra sheep from India using microsatellite analysis. Asian Australasian J Anim Scienc 2006; 19 (7):938-942.
Arora R, Bhatia S, Jain A. Morphological and genetic characterisation of Ganjam sheep. Anim Gen Resources 2010; 46:1-9.
Awobajo OK, Salako AE, Osaiyuwu OH. Analysis of genetic structure of Nigerian West African Dwarf goats by microsatellite markers. Small Rumin Res 2015: In press.
Álvarez I, Capote J, Traoré A, Fonseca N, Perez K, Cuervo M, Fernández I, Goayche F. Genetic relationships of the Cuban hair sheep inferred from microsatellite polymorphism. Small Rumin Res 2012; 104:89-93.
Barrios C. Guía práctica de ovinocultura enfocada hacia la producción de carne. Finagro 2005. [Access date: August 9th, 2016]. URL: http://www.academia.edu/14189463
Ben SZ, Maretto F, Charfi-Cheikrouha F, Cassandro M. Genetic diversity, structure, and breed relationships in Tunisian sheep. Small Rumin Res 2014;119:52-56.
Blackburn HD, Toishibekov Y, Toishibekov M, Welsh CS, Spiller SF, Brown M, Paiva SR.Genetic diversity of Ovis ariespopulations near domestication centers and in the new world. Springer genetic 2011; 139:1169-1178.
Bozzi R, Degl’Innocenti P, Rivera Diaz P. Genetic characterization and breed assignment in five Italian sheep breeds using microsatellite markers. Small Rumin Res 2009; 85(1):50-57.
Ciani E, Ciampolini R, D’Andrea MS, Castellana E, Cecchi F, Incoronato C, D’Angelo F, Albenzio M, Pilla F, Matassino D. Cianci D. Analysis of genetic variability within and among Italian sheep breeds reveals population stratification and suggests the presence of a phylogeographic gradient. Small Rumin Res 2013; 112:21-27.
Delgado JV, León JM, Gómez, M, Nogales S, Camacho ME. Las razas ovinas ibéricas y su participación en la colonización de Iberoamérica. Biodiversidad ovina Iberoamericana. Caracterización y uso sustentable 2009; 14:18-40.
Dixit SP, Verma NK, Aggarwal RAK. Genetic diversity and relationship among Indian goat breeds based on microsatellite markers. Small Rumin Res 2012;105:38-45.
Dodgson JB, Cheng HH, Okimoto R. DNA marker technology: a revolution in animal genetics. Poult Sci 1997; 76:1108-1113.
Egito AA, Mariante AS, Albuquerque MSM. Programa brasileiro de conservacão de recursos genéticos animais. Arch Zootec 2012; 51:193-194.
Evanno G, Regnaut S, Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol 2005; 14:2611-2620.
FAO. Global project for the maintenance of domestic animal genetic diversity (MoDAD). 1996.
FAO. Molecular genetic characterization of animal genetic resources. FAO Animal Production and Health Guidelines. Roma; 2011.
Gornas N, Weimann C, El Hussien A. Genetic characterization of local Sudanese sheep breeds using DNA markers. Small Rumin Res 2011; 95:27-33.
Goudet J. FSTAT (version 2.9.3.2): a program to estimate and test gene diversities and fixation indices. F-statistics. J Hered 2002; 86:485-486.
Jiang W, Wang Y, Xing J, Jiang Y. Evaluation of the genetic diversity of Laiwu pigs using twenty-seven microsatellite markers. Biochem Sys Ecol 2015; 62:1-5.
Kayang BB, Inoue-Murayama M, Hoshi T. Microsatellite loci in Japanese quail and cross-species amplification in chicken and guinea fowl. Genet Select Evol2002; 34:233-253.
Kim KS, Yeo JS, Choi CB. Genetic diversity of North-East Asian cattle based on microsatellite data. Anim Genet 2002; 33(3):201-204.
Kugonza DR, Jianlin H, Nabasirye M. Genetic diversity and differentiation of Ankole cattle populations in Uganda inferred from microsatellite data. Lives Sci 2011;135:140-147.
Martínez R, Vásquez R, Ballesteros H. El ovino criollo en Colombia, conservación. Caracterización y evaluación de la variabilidad genética. Biodiversidad ovina Iberoamericana. Caracterización y uso sustentable 2009; 18(33):235-261.
Muigai AWT, Okeyo AM, Kwallah AK, Mburu D, Hanotte O. Characterization of sheep populations of Kenya using microsatellite markers: Implications for conservation and management of indigenous sheep populations. South African J Anim Scienc 2009; 39(1):93-96.
Nanekarani S, Amirinia C, Amirmozafari N, Torshizi RV, Gharahdaghi A. Genetic variation among pelt sheep population using microsatellite markers. Afr J Biotechnol 2010;9(44):7437-7445.
Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press; 1987.
Ochipinti G, Núñez L, Cazal C, Samudio A, Castro L, Ramírez L, León D, Martínez A, Oka A, Landi V, Delgado JV, Martínez O. Diversidad genética en ovejas de los humedades de la región Oriental del Paragüay. Actas Iberoamericanas de conservación animal 2012; 2:227-230.
Park SDE. Trypanotolerance in West African cattle and the population genetic effects of selection. Ph.D. thesis, University of Dublin; 2001.
Pastrana R, Calderón C. El ovino criollo colombiano. Los animales domésticos criollos y colombianos en la producción pecuaria nacional 1996; 1:65-71.
Peakall R, Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics 2012;28:2537-2539.
Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics2000; 155:945-959.
Quiroz J, Martínez A, Landi V, Zaragoza L, Martínez R, Perezgrovas G, Vega-Pla J.L. Relación genética de la raza ovina de Chiapas con algunas razas ovinas españolas. Arch Zootec 2007; 56(1):441-447.
Radhika G, Raghavan KC, Aravindakshan TV, Thirupathy V. Genetic diversity and population structure analysis of native and crossbred goat gentic groups of Kerala, India. Small Rumin Res 2015: In press.
Rousset F. Genepop’007: a complete reimplementation of the Genepop software for Windows and Linux. Mol Ecol Resour 2008; 8:103-106.
Sodhi M, Mukesh M, Bhatia S. Characterizing Nali and Chokla sheep differentiation with microsatellite markers. Small Rumin Res 2006; 65:185-192.
Souza CA, Paiva SR, McManus CM. Genetic diversity and assessment of 23 microsatellite markers for parentage testing of Santa Ines hair sheep in Brazil.
Genet Mol Res 2012; 8:1217-1229. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis, Version 6.0. Mol Biol Evol 2013; 30:2725-2729.
Tolone M, Mastrangelo S, Rosa AJM. Genetic diversity and population structure of Sicilian sheep breeds using microsatellite markers. Small Rumin Res 2012;102:18-25.
Weir BS, Cockerham C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution1984;38:1358-1370.
Zhong T, Han J, Guo J. Genetic diversity of Chinese indigenous sheep breeds inferred from microsatellite markers. Small Rumin Res 2010; 90:88-94.
Zuccaro A, Bordonaro S, Criscione A, Guastella M, Perrotta G, Blasi M, D’Urso G, Marletta D. Genetic diversity and admixture analysis of Sanfratellano and three other Italian horse breeds assessed by microsatellite markers. Animal 2008; 2(7):991-998.
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Copyright (c) 2016 Revista Colombiana de Ciencias Pecuarias
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
Os autores autorizam a RCCP a reimprimir o material nela publicado.
A revista permite que o(s) autor(es) detenham os direitos autorais sem restrições, e permitirá que o(s) autor(es) mantenham os direitos de publicação sem restrições.