Diversidad genética en el banco de germoplasma de morera [Morus spp. (Rosales: Moraceae)] de la Granja Experimental “El Pilamo”, Universidad Tecnológica de Pereira, Pereira (Risaralda), Colombia
DOI:
https://doi.org/10.17533/udea.acbi.14240Palabras clave:
AFLPs, caracterización molecular, estructura poblacional, Morus spp., ColombiaResumen
Usando los polimorfismos de longitud de fragmentos amplificados (AFLPs) se analizó la diversidad genética de 31 accesiones de morera, Morus spp. (Moraceae) del banco de germoplasma de la granja experimental “El Pílamo” de la Universidad Tecnológica de Pereira (Colombia). Se utilizaron 5 combinaciones de iniciadores AFLPs que generaron 152 bandas polimórficas con una correlación promedio del 20% y permitieron analizar el 64,12% de la diversidad total de estas accesiones. Se evaluaron la diversidad genética, las relaciones existentes entre las accesiones y el grado de estructuración. Los resultados de las combinaciones de iniciadores mostraron valores de heterocigosidad promedio de 0,2332 y diversidad genética de 0,2302. El análisis de conglomerados mostró que cada una de las 31 accesiones tiene diferente genotipo. Cinco grupos definidos fueron así establecidos. El análisis de AMOVA permitió establecer que el 77% de la diversidad estaba dentro de la población y el 23% entre los grupos definidos molecularmente. Los grupos mostraron un índice FST de 0,235 y un valor de flujo de genes de 1,1. Se concluye que los grupos establecidos molecularmente mostraron valores elevados a nivel de distancia genética y loci polimórficos, especialmente las poblaciones 1 y 5. Se concluye que el genoma de morera presenta un alto grado de complejidad como se demuestra de acuerdo con la colección estudiada.
Descargas
Citas
Awasthi AK, Nagaraja GM, Naik GV, Kanginakudru S, Thangavelu K, Nagaraju J. 2004. Genetic diversity and relationships in mulberry (genus Morus) as revealed by RAPD and ISSR marker assays. BMC Genetics, 5: 1-8.
Bhattacharya E, Ranade SA. 2001. Molecular distinction amongst varieties of mulberry using RAPD and DAMD profiles. BMC Plant Biology, 1 (3): 1-8.
Cappellozza L, Coradazzi AT, Tornadore N. 1995. Studies on the phenotypic variability of seven cultivars of Morus alba L and three of Morus multicaulis P. (Moraceae) - Part I. Sericologia, 35 (2): 257-270.
Datta RK [Internet]. 2000. Mulberry cultivation and utilization in India. FAO electronic conference on mulberry for animal production (Morus L). Fecha de acceso: 23 de enero de 2012. Disponible en: <http://www.fao.org/DOCREP/005/X9895E/x9895e04.htm#TopOfPage>.
Doyle JJ, Doyle JL. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12 (1): 13-15.
Excoffier L. 1995. Analysis of molecular variance (AMOVA) version 1.55. Geneva (Italia): LGB, University of Geneva.
Fotadar RK, Dandin SB. 1998. Genetic divergence in mulberry. Sericologia, 38 (1): 115-125.
Hirano H. 1982. Varietal differences of leaf protein profiles in mulberry. Phytochemistry, 21: 1513-1518.
Kalpana D, Hyuk Choi S, Ki Choi T, Senthil K, Soo Lee Y. 2012. Assessment of genetic diversity among varieties of mulberry using RAPD and ISSR fingerprinting. Scientia Horticulturae, 134: 79-87.
Katsumata F. 1971. Shape of idioblast in mulberry leaves with special reference to the classification of mulberry trees. Journal of Sericulture Science of Japan, 40 (4): 312-322.
Lynch M, Milligan BG. 1994. Analysis of population genetic structure with RAPD markers. Molecular Ecology, 3: 91-99
Mantel NA. 1967. The detection of disease clustering and a generalized regression approach. Cancer Research, 27: 209-220.
Miller MP. 1997. Tools for population genetic analyses (TFPGA). Version 1.3. Computer software distributed by author.
Nei M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proceeding of the National Academy of Science, 70: 3321-3323.
Nei M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 538-590.
Peakall R, Smouse PE. 2006. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic, software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6: 288-295.
Rohlf FJ. 2002. NTSYS pc: Numerical taxonomy system, Version 2.1. Setauket (New York, U. S. A.): Exeter Publishing.
Sánchez MD. 2000. Mulberry, an exceptional forage available almost worldwide. [Internet], Fecha de acceso: 2012 enero 23. Disponible en: <http://www.fao.org/ag/AGA/AGAP/FRG/Mulberry/Papers/HTML/
Mulbwar2.htm>.
Shabir AW, Bhat MA, Malik GN, Kamili AS, Mir MR, Bhat SA, Wani N, Razvi SM, Akhtar S, Bhat KA. 2010. Molecular markers and their role in mulberry improvement. International Journal of Current Research, 4: 20-24.
Sharma A, Sharma R, Machii H. 2000. Assesment of genetic diversity in a Morus germplasm collection using fluorescence-based AFLP markers. Theoretical and Applied Genetics, 101: 1049-1055.
Sneath PHA, Sokal RR. 1973. Numerical taxonomy, the principles and practice of numerical classification. San Francisco (U. S. A.): W. H. Freeman & Co. p. 573.
Sokal RR, Rohlf FJ. 2012. Biometry: the principles and practice of statistics in biological research. 4th ed. New York (U. S. A.): W. H. Freeman and Co. p. 937.
Thome J, Gonzáles DO, Beebe S, Duque MC. 1996. AFLP analysis of gene pool of a wild bean core collection. Crop Science, 36: 1375-1384.
Vijayan K, Chatterjee SN. 2003. ISSR profiling of Indian cultivars of mulberry (Morus spp.) and its relevance tobreeding programs. Euphytica, 131: 53-63.
Vijayan K, Nair CV, Chatterjee SN. 2009. Diversification of mulberry (Morus indica var. S36), a vegetatively propagated tree species. Caspian Journal of Enviromental Science, 7 (1): 23-30.
Vijayan K, Saratchandra B, Teixeira da Silva JA. 2011. Germplasm conservation in mulberry (Morus spp.). Scientia Horticulturae, 128: 371-379.
Vos P, Hogers R, Bleeker M, van der Lee T, Hornes M, Frijter A, Pot J, Kuiper M, Zabeau M. 1995. A new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acid Research, 23: 4407-4414.
Wang ZW, Yu MD. 2001. AFLP analysis of genetic background of polyploid breeding materials of mulberry. Acta Sericologica Sinica, 27 (3): 170-176.
Wright S. 1931. Evolution in Medelian populations. Genetics, 28: 114-138.
Xiang ZH, Zhang Z, Yu MD. 1995. Preliminary report on the application of RAPD in systematics of Morus L. Acta Sericologica Sinica, 21 (4): 204-208.
Yamanouchi H, Koyama A, Takyu T, Muramatsu N. 2010. Nuclear DNA amounts in diploid mulberry species (Morus spp.). Journal of Insect Biotechnology and Sericology, 79 (1): 1-8.
Yang G W, Feng L C, Jing C J. 2003. Analysis of genetic structure variance among mulberry (Morus spp L.) Populations. Acta Sericologica Sinica. 29 (4): 323-329.
Yeh FC, Yang RC, Boyle TBJ, Ye ZH, Mao JX. 1997. POPGENE, the user-friendly shareware for population genetic analysis. Canadá: Universidad de Alberta.
Zhao WG, Pan YL, Huang MR. 2000. RAPD analysis for the germplasm resources of genus mulberry. Acta Sericologica Sinica, 4: 1-8.
Zhao WG, Pan YL. 2004. Genetic diversity of genus Morus revealed by RAPD markers in China. International Journal of Agriculture y Biology, 6: 950-954.
Zhao WG, Miao XX, Pan YL, Huang YP. 2005. Isolation and characterization of microsatellite loci from the mulberry, Morus L. Plant Science, 168 (2): 519-525.
Zhao WG, Miao XX, Zang B, Zhang L, Pan YL, Huang YP. 2006. Construction of fingerprinting and genetic diversity of mulberry cultivars in China by ISSR markers. Acta Genetica Sinica, 33 (9): 851-860.
Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D. 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)- anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20: 176-183.
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Los autores autorizan de forma exclusiva, a la revista Actualidades Biológicas a editar y publicar el manuscrito sometido en caso de ser recomendada y aceptada su publicación, sin que esto represente costo alguno para la Revista o para la Universidad de Antioquia.
Todas las ideas y opiniones contenidas en los artículos son de entera responsabilidad de los autores. El contenido total de los números o suplementos de la revista, está protegido bajo Licencia Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional, por lo que no pueden ser empleados para usos comerciales, pero sí para fines educativos. Sin embargo, por favor, mencionar como fuente a la revista Actualidades Biológicas y enviar una copia de la publicación en que fue reproducido el contenido.