Genómica comparativa de los genes localizados en la región critica del cromosoma 21 asociada con el síndrome de Down

Abstract

Análisis previos en Síndrome de Down (SD) han identificado una región del cromosoma 21 conocida como Región Crítica del SD (DSCR) en donde se localizan algunos genes cuya expresión modularía las principales características clínicas de esta patología. Sin embargo, actualmente existe poca información detallada sobre la arquitectura de la cromatina asociada con la DSCR. Debido a esto, se realizó un paseo cromosómico in silico a lo largo de 21Mb de la porción distal del brazo q del cromosoma 21 donde se localiza la DSCR. Para este análisis, se tomó como referencia la información de las bases de datos como el NCBI, el Genome Browser - UCSC y el proyecto HapMap. Algunas de las covariables genómicas registradas fueron el número de polimorfismos de nucleótido único (SNP), de islas CpG, de secuencias repetidas, las tasas de recombinación y el estado topológico de la cromatina asociada. La existencia de una estructura heterogénea de secuencias codificantes y de elementos repetidos, fue asimétrica incrementándose el número de islas CpG y genes de la región 21q22.12 hacia 21q22.2. La mayor tasa de recombinación para mujeres calculada en nuestro estudio, se registró entre las bandas 21q22.13 y 21q22.3. Los genes DSCR 6 y 9 presentaron un elevado grado de metilación en islas CpG tanto en fibroblastos normales como en trisómicos. En el gen DSCR2 se observó un alto grado de descondesación cromatínica además de metilación de diferentes residuos de Lisina H3. Este trabajo permitió confirmar y expandir el conocimiento a nivel genómico y molecular de la no disyunción en SD, utilizando herramientas bioinformáticas de uso libre. Además, se determinó la existencia de un ambiente genómico el cual explicaría que en la no disyunción, operarían complejas interacciones genómicas y epigenéticas sobre algunos procesos meióticos.