Acreditación internacional para tipificación HLA de alta resolución por secuencia NGS para 11 loci (HLA-A, B, C DRBI, DRB3/B4/B5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1)

Autores/as

  • Juan Jose Yunis 1)Director Científico, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia. SAS 2) Profesor Titular, Departamento de Patología, Facultad de Medicina e instituto de Genética, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C. https://orcid.org/0000-0001-7688-9094
  • Mayorie Antonieta Dakkak Araujo Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS
  • Adriana Lucia Chamorro Jimenez Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS
  • Natalia Arias Morales Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS
  • Jhon Henry Rodriguez Matiz Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS https://orcid.org/0000-0003-2265-8404
  • Alexandra Cortes Hernandez Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Palabras clave:

Prueba de Histocompatibilidad;, Análisis de Secuencia, Donantes de Tejidos

Resumen

Introducción: la tipificación HLA de alta resolución es requisito para los donantes intrafamiliares HLA haploidénticos, y para la selección de donantes no relacionados de registros internacionales y de bancos de unidad de cordón umbilical. Hasta la fecha, toda tipificación confirmatoria se llevaba a cabo fuera del país, ya que no existía ningún laboratorio acreditado internacionalmente para llevar a cabo estos estudios. Desde el 2017, nuestra institución inició la tipificación HLA de alta resolución por secuencia NGS con la plataforma TruSight HLA de Illumina y, posteriormente, con la plataforma AlloSeqTx de CareDx obteniendo acreditación para la tipificación NGS en el año 2020. Desde el año 2021 iniciamos análisis con la plataforma Miafora (Immucor Corp). Este año hemos recibido acreditación internacional por la European Federation of Inmunogenetics (EFI) para el análisis HLA de alta resolución por secuencia para donantes intrafamiliar relacionado y para donantes no relacionados, tanto de unidades de cordón umbilical como de
registros internacionales de donantes.
Métodos: se llevó a cabo validación y acreditación de la plataforma Miafora HLA 11 Loci por NGS en un equipo MySeq utilizando 10 muestras (retrospectivas) de pruebas de intercomparación internacional del programa de la American Society for Histocompatibility and Inmunogenetics (ASHI) y 20 muestras prospectivas del mismo programa. Se evaluó la concordancia de los resultados obtenidos a partir de las muestras procesadas con los reportes de intercomparación emitidos por ASHI.
Resultados: de un total de 30 muestras analizadas (660 loci) se obtuvo concordancia en la tipificación en todas ellas. Sin embargo, se observó discrepancia en el formato de reporte en 2 loci (3,3%) debido a que no se tuvieron en cuenta posibles ambigüedades en los G-Groups o en los P-Groups (https://hla.alleles.org/alleles/g_groups.html) en la nomenclatura utilizada. Se llevaron a cabo las acciones correctivas para resolver los puntos relacionados con nomenclatura. Se obtuvo acreditación internacional para
Ttipificación HLA de Alta Resolución por Secuencia NGS.

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Biografía del autor/a

Juan Jose Yunis, 1)Director Científico, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia. SAS 2) Profesor Titular, Departamento de Patología, Facultad de Medicina e instituto de Genética, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C.

1)Director Científico, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia. SAS 2) Profesor Titular, Departamento de Patología, Facultad de Medicina e instituto de Genética, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá, D.C.

Mayorie Antonieta Dakkak Araujo, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Coordinadora área inmunogenética

Adriana Lucia Chamorro Jimenez, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Analista área Inmunogenética

Natalia Arias Morales, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Analista área inmunogenética

Jhon Henry Rodriguez Matiz, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Analista área inmunogenética

Alexandra Cortes Hernandez, Servicios Médicos Yunis Turbay y Cia SAS

Analista área Inmunogenética

Citas

Yin Y, Butler C, Zhang Q. Challenges in the application of NGS in the clinical laboratory. Hum Immunol. 2021 Nov;82(11):812-819. doi: 10.1016/j.humimm.2021.03.011. Epub 2021 Apr 21. PMID: 33892986.

Publicado

26-10-2023

Cómo citar

1.
Yunis JJ, Dakkak Araujo MA, Chamorro Jimenez AL, Arias Morales N, Rodriguez Matiz JH, Cortes Hernandez A. Acreditación internacional para tipificación HLA de alta resolución por secuencia NGS para 11 loci (HLA-A, B, C DRBI, DRB3/B4/B5, DQA1, DQB1, DPA1, DPB1). Iatreia [Internet]. 26 de octubre de 2023 [citado 27 de febrero de 2024];36(2-S). Disponible en: https://revistas.udea.edu.co/index.php/iatreia/article/view/354606

Número

Sección

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